対象サーバをIPアドレスで登録したいが問題ないか

対象サーバをIPアドレスで登録することは可能です。

【設定箇所】
サーバ名：画面表示やアクセスログに使用するサーバ名またはIPアドレス
接続サーバ名：接続に使用する（接続可能な）サーバ名またはIPアドレス